Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms