Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TSPOP30536 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TSPOP30536 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TSPOP30536 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TSPOP30536 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TSPOP30536 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TSPOP30536 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TSPOP30536 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TSPOP30536 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TSPOP30536 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TSPOP30536 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TSPOP30536 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TSPOP30536 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TSPOP30536 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TSPOP30536 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TSPOP30536 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TSPOP30536 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TSPOP30536 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TSPOP30536 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TSPOP30536 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TSPOP30536 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TSPOP30536 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TSPOP30536 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TSPOP30536 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TSPOP30536 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TSPOP30536 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TSPOP30536 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TSPOP30536 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TSPOP30536 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TSPOP30536 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TSPOP30536 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TSPOP30536 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TSPOP30536 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TSPOP30536 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TSPOP30536 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TSPOP30536 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TSPOP30536 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TSPOP30536 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TSPOP30536 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TSPOP30536 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TSPOP30536 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TSPOP30536 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TSPOP30536 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TSPOP30536 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TSPOP30536 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TSPOP30536 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TSPOP30536 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TSPOP30536 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TSPOP30536 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TSPOP30536 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TSPOP30536 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TSPOP30536 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TSPOP30536 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TSPOP30536 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TSPOP30536 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TSPOP30536 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TSPOP30536 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TSPOP30536 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TSPOP30536 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TSPOP30536 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TSPOP30536 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TSPOP30536 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TSPOP30536 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TSPOP30536 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TSPOP30536 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TSPOP30536 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TSPOP30536 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TSPOP30536 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TSPOP30536 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TSPOP30536 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TSPOP30536 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TSPOP30536 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TSPOP30536 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TSPOP30536 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TSPOP30536 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TSPOP30536 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TSPOP30536 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TSPOP30536 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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