Protein–RNA interactions for Protein: P29074

PTPN4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4P29074 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN4P29074 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN4P29074 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN4P29074 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN4P29074 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN4P29074 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN4P29074 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN4P29074 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN4P29074 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN4P29074 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN4P29074 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN4P29074 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPN4P29074 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPN4P29074 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPN4P29074 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPN4P29074 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPN4P29074 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPN4P29074 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPN4P29074 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPN4P29074 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPN4P29074 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPN4P29074 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPN4P29074 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN4P29074 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms