Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO1P25800 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO1P25800 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO1P25800 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO1P25800 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO1P25800 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO1P25800 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO1P25800 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO1P25800 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO1P25800 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO1P25800 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO1P25800 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO1P25800 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO1P25800 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO1P25800 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO1P25800 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO1P25800 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO1P25800 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO1P25800 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO1P25800 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO1P25800 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO1P25800 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO1P25800 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO1P25800 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO1P25800 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO1P25800 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO1P25800 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO1P25800 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO1P25800 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO1P25800 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO1P25800 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO1P25800 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO1P25800 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO1P25800 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO1P25800 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO1P25800 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO1P25800 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO1P25800 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO1P25800 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO1P25800 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO1P25800 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO1P25800 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO1P25800 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO1P25800 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO1P25800 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO1P25800 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO1P25800 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms