Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1P23443 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms