Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms