Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms