Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VCLP18206 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VCLP18206 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VCLP18206 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VCLP18206 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VCLP18206 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VCLP18206 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VCLP18206 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VCLP18206 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VCLP18206 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VCLP18206 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VCLP18206 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VCLP18206 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VCLP18206 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VCLP18206 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VCLP18206 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VCLP18206 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VCLP18206 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VCLP18206 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VCLP18206 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VCLP18206 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VCLP18206 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VCLP18206 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VCLP18206 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VCLP18206 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VCLP18206 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VCLP18206 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VCLP18206 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VCLP18206 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VCLP18206 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VCLP18206 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VCLP18206 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VCLP18206 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VCLP18206 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VCLP18206 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VCLP18206 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VCLP18206 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VCLP18206 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VCLP18206 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VCLP18206 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VCLP18206 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VCLP18206 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VCLP18206 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VCLP18206 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VCLP18206 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VCLP18206 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VCLP18206 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VCLP18206 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VCLP18206 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VCLP18206 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VCLP18206 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VCLP18206 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VCLP18206 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VCLP18206 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VCLP18206 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VCLP18206 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VCLP18206 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VCLP18206 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VCLP18206 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VCLP18206 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VCLP18206 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VCLP18206 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VCLP18206 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VCLP18206 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VCLP18206 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VCLP18206 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VCLP18206 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
VCLP18206 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VCLP18206 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VCLP18206 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VCLP18206 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VCLP18206 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VCLP18206 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
VCLP18206 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VCLP18206 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VCLP18206 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VCLP18206 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VCLP18206 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VCLP18206 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VCLP18206 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VCLP18206 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VCLP18206 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VCLP18206 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VCLP18206 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VCLP18206 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VCLP18206 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VCLP18206 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VCLP18206 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VCLP18206 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VCLP18206 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VCLP18206 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VCLP18206 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VCLP18206 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VCLP18206 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VCLP18206 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VCLP18206 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VCLP18206 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VCLP18206 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VCLP18206 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VCLP18206 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms