Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPI1P17947 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPI1P17947 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPI1P17947 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPI1P17947 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPI1P17947 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPI1P17947 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPI1P17947 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPI1P17947 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPI1P17947 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPI1P17947 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPI1P17947 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPI1P17947 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPI1P17947 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPI1P17947 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPI1P17947 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPI1P17947 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPI1P17947 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SPI1P17947 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SPI1P17947 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPI1P17947 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPI1P17947 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPI1P17947 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SPI1P17947 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPI1P17947 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPI1P17947 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPI1P17947 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPI1P17947 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPI1P17947 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPI1P17947 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPI1P17947 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPI1P17947 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPI1P17947 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPI1P17947 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPI1P17947 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPI1P17947 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPI1P17947 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPI1P17947 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPI1P17947 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPI1P17947 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPI1P17947 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPI1P17947 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPI1P17947 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPI1P17947 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPI1P17947 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPI1P17947 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPI1P17947 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPI1P17947 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPI1P17947 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPI1P17947 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPI1P17947 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPI1P17947 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPI1P17947 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPI1P17947 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPI1P17947 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPI1P17947 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SPI1P17947 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPI1P17947 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPI1P17947 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPI1P17947 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPI1P17947 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPI1P17947 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPI1P17947 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPI1P17947 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPI1P17947 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPI1P17947 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPI1P17947 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPI1P17947 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPI1P17947 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPI1P17947 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPI1P17947 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPI1P17947 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPI1P17947 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPI1P17947 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPI1P17947 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPI1P17947 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPI1P17947 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPI1P17947 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPI1P17947 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPI1P17947 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPI1P17947 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPI1P17947 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPI1P17947 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPI1P17947 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPI1P17947 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPI1P17947 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPI1P17947 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPI1P17947 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPI1P17947 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPI1P17947 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPI1P17947 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SPI1P17947 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPI1P17947 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPI1P17947 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPI1P17947 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPI1P17947 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPI1P17947 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPI1P17947 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPI1P17947 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPI1P17947 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms