Protein–RNA interactions for Protein: P17029

ZKSCAN1, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN1P17029 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZKSCAN1P17029 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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