Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms