Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEFHP12036 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEFHP12036 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEFHP12036 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEFHP12036 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEFHP12036 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEFHP12036 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEFHP12036 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEFHP12036 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEFHP12036 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEFHP12036 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEFHP12036 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEFHP12036 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEFHP12036 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEFHP12036 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NEFHP12036 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEFHP12036 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEFHP12036 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEFHP12036 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEFHP12036 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEFHP12036 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEFHP12036 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEFHP12036 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NEFHP12036 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEFHP12036 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEFHP12036 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEFHP12036 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEFHP12036 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEFHP12036 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEFHP12036 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEFHP12036 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEFHP12036 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEFHP12036 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEFHP12036 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEFHP12036 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEFHP12036 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEFHP12036 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEFHP12036 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NEFHP12036 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEFHP12036 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEFHP12036 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEFHP12036 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NEFHP12036 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEFHP12036 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEFHP12036 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEFHP12036 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NEFHP12036 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NEFHP12036 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEFHP12036 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEFHP12036 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEFHP12036 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEFHP12036 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEFHP12036 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEFHP12036 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEFHP12036 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEFHP12036 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEFHP12036 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEFHP12036 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEFHP12036 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEFHP12036 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEFHP12036 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEFHP12036 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEFHP12036 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEFHP12036 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEFHP12036 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEFHP12036 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEFHP12036 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEFHP12036 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEFHP12036 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEFHP12036 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEFHP12036 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEFHP12036 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEFHP12036 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEFHP12036 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEFHP12036 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEFHP12036 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEFHP12036 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEFHP12036 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEFHP12036 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEFHP12036 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEFHP12036 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NEFHP12036 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEFHP12036 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEFHP12036 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEFHP12036 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEFHP12036 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEFHP12036 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEFHP12036 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
NEFHP12036 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEFHP12036 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEFHP12036 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEFHP12036 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
NEFHP12036 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEFHP12036 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEFHP12036 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEFHP12036 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEFHP12036 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEFHP12036 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEFHP12036 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEFHP12036 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms