Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLI3P10071 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLI3P10071 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLI3P10071 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
GLI3P10071 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLI3P10071 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLI3P10071 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLI3P10071 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLI3P10071 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLI3P10071 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLI3P10071 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLI3P10071 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLI3P10071 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLI3P10071 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLI3P10071 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLI3P10071 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLI3P10071 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLI3P10071 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLI3P10071 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI3P10071 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI3P10071 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI3P10071 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI3P10071 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI3P10071 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI3P10071 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI3P10071 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI3P10071 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI3P10071 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI3P10071 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI3P10071 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI3P10071 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI3P10071 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI3P10071 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI3P10071 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI3P10071 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI3P10071 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI3P10071 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI3P10071 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI3P10071 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI3P10071 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI3P10071 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI3P10071 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI3P10071 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI3P10071 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI3P10071 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI3P10071 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI3P10071 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI3P10071 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI3P10071 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI3P10071 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI3P10071 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI3P10071 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI3P10071 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI3P10071 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI3P10071 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI3P10071 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI3P10071 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI3P10071 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI3P10071 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI3P10071 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI3P10071 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI3P10071 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI3P10071 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI3P10071 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI3P10071 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI3P10071 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI3P10071 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI3P10071 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI3P10071 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI3P10071 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI3P10071 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI3P10071 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI3P10071 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI3P10071 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI3P10071 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI3P10071 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI3P10071 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI3P10071 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI3P10071 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI3P10071 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI3P10071 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI3P10071 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI3P10071 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLI3P10071 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLI3P10071 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLI3P10071 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLI3P10071 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLI3P10071 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLI3P10071 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLI3P10071 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLI3P10071 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLI3P10071 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLI3P10071 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLI3P10071 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLI3P10071 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GLI3P10071 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLI3P10071 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLI3P10071 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLI3P10071 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLI3P10071 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms