Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC192P0DO97 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms