Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms