Protein–RNA interactions for Protein: P07988

SFTPB, Pulmonary surfactant-associated protein B, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPBP07988 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms