Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ITGAVP06756 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGAVP06756 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms