Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
F13BP05160 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13BP05160 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13BP05160 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13BP05160 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13BP05160 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13BP05160 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13BP05160 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13BP05160 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13BP05160 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13BP05160 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13BP05160 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13BP05160 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13BP05160 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13BP05160 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13BP05160 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13BP05160 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13BP05160 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13BP05160 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13BP05160 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
F13BP05160 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
F13BP05160 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13BP05160 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13BP05160 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13BP05160 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13BP05160 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13BP05160 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
F13BP05160 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13BP05160 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13BP05160 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13BP05160 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
F13BP05160 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13BP05160 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13BP05160 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13BP05160 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13BP05160 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13BP05160 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
F13BP05160 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F13BP05160 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
F13BP05160 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F13BP05160 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F13BP05160 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F13BP05160 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F13BP05160 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F13BP05160 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F13BP05160 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F13BP05160 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F13BP05160 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F13BP05160 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F13BP05160 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F13BP05160 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F13BP05160 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F13BP05160 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms