Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC1P02654 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC1P02654 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC1P02654 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC1P02654 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC1P02654 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC1P02654 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC1P02654 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC1P02654 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC1P02654 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC1P02654 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC1P02654 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC1P02654 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC1P02654 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC1P02654 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC1P02654 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC1P02654 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC1P02654 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC1P02654 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC1P02654 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC1P02654 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC1P02654 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC1P02654 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC1P02654 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC1P02654 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC1P02654 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC1P02654 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC1P02654 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC1P02654 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC1P02654 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC1P02654 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC1P02654 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC1P02654 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC1P02654 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC1P02654 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC1P02654 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC1P02654 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC1P02654 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC1P02654 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC1P02654 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC1P02654 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC1P02654 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC1P02654 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC1P02654 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC1P02654 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC1P02654 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC1P02654 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC1P02654 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOC1P02654 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOC1P02654 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOC1P02654 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOC1P02654 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOC1P02654 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
APOC1P02654 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOC1P02654 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOC1P02654 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC1P02654 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC1P02654 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC1P02654 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC1P02654 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC1P02654 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC1P02654 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC1P02654 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC1P02654 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC1P02654 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC1P02654 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC1P02654 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC1P02654 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC1P02654 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC1P02654 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC1P02654 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC1P02654 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC1P02654 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC1P02654 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC1P02654 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC1P02654 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC1P02654 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC1P02654 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC1P02654 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC1P02654 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC1P02654 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC1P02654 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC1P02654 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC1P02654 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC1P02654 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC1P02654 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC1P02654 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC1P02654 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC1P02654 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC1P02654 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC1P02654 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC1P02654 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC1P02654 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC1P02654 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC1P02654 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC1P02654 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC1P02654 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC1P02654 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC1P02654 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC1P02654 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms