Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP3LO60238 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms