Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PDE6DO43924 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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PDE6DO43924 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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PDE6DO43924 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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