Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms