Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms