Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms