Protein–RNA interactions for Protein: A6BM72

MEGF11, Multiple epidermal growth factor-like domains protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEGF11A6BM72 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MEGF11A6BM72 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MEGF11A6BM72 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MEGF11A6BM72 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MEGF11A6BM72 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MEGF11A6BM72 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MEGF11A6BM72 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MEGF11A6BM72 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MEGF11A6BM72 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MEGF11A6BM72 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MEGF11A6BM72 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MEGF11A6BM72 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MEGF11A6BM72 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MEGF11A6BM72 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MEGF11A6BM72 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MEGF11A6BM72 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MEGF11A6BM72 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MEGF11A6BM72 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MEGF11A6BM72 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MEGF11A6BM72 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MEGF11A6BM72 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MEGF11A6BM72 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MEGF11A6BM72 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MEGF11A6BM72 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MEGF11A6BM72 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEGF11A6BM72 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms