Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms