Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms