Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms