Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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KCNIP3Q9Y2W7 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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KCNIP3Q9Y2W7 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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KCNIP3Q9Y2W7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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KCNIP3Q9Y2W7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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KCNIP3Q9Y2W7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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KCNIP3Q9Y2W7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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KCNIP3Q9Y2W7 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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KCNIP3Q9Y2W7 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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KCNIP3Q9Y2W7 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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KCNIP3Q9Y2W7 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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KCNIP3Q9Y2W7 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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KCNIP3Q9Y2W7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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KCNIP3Q9Y2W7 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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