Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN37

VPS4A, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4AQ9UN37 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS4AQ9UN37 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
VPS4AQ9UN37 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VPS4AQ9UN37 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VPS4AQ9UN37 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
VPS4AQ9UN37 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS4AQ9UN37 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS4AQ9UN37 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS4AQ9UN37 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS4AQ9UN37 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS4AQ9UN37 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS4AQ9UN37 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS4AQ9UN37 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS4AQ9UN37 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS4AQ9UN37 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS4AQ9UN37 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS4AQ9UN37 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS4AQ9UN37 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS4AQ9UN37 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS4AQ9UN37 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS4AQ9UN37 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS4AQ9UN37 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS4AQ9UN37 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS4AQ9UN37 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS4AQ9UN37 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS4AQ9UN37 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS4AQ9UN37 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS4AQ9UN37 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS4AQ9UN37 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS4AQ9UN37 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS4AQ9UN37 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS4AQ9UN37 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS4AQ9UN37 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS4AQ9UN37 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS4AQ9UN37 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS4AQ9UN37 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS4AQ9UN37 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS4AQ9UN37 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS4AQ9UN37 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS4AQ9UN37 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS4AQ9UN37 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS4AQ9UN37 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS4AQ9UN37 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS4AQ9UN37 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS4AQ9UN37 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS4AQ9UN37 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms