Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNRF3Q9ULT6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms