Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MKLN1Q9UL63 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms