Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT7

FBXL3, F-box/LRR-repeat protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL3Q9UKT7 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL3Q9UKT7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms