Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms