Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MLH3Q9UHC1 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms