Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms