Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms