Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms