Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms