Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms