Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms