Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms