Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms