Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms