Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCF6

TRPM3, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM3Q9HCF6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPM3Q9HCF6 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms