Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms