Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHACTR1Q9C0D0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms