Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms