Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SYCP2Q9BX26 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYCP2Q9BX26 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYCP2Q9BX26 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYCP2Q9BX26 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYCP2Q9BX26 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYCP2Q9BX26 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SYCP2Q9BX26 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SYCP2Q9BX26 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYCP2Q9BX26 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYCP2Q9BX26 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYCP2Q9BX26 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYCP2Q9BX26 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYCP2Q9BX26 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYCP2Q9BX26 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYCP2Q9BX26 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYCP2Q9BX26 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SYCP2Q9BX26 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYCP2Q9BX26 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYCP2Q9BX26 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYCP2Q9BX26 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYCP2Q9BX26 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms