Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT17Q9BSW7 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
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